Les Facultés de Médecine de Toulouse Purpan et Toulouse Rangueil sont deux composantes de l'Université Toulouse III - Paul Sabatier.
Elles forment avec le Centre Hospitalier Régional, le Centre Hospitalier Universitaire.
Les Facultés sont dirigées par  les doyens élus par les Conseils de Faculté pour 5 ans.
 
Les Facultés sont administrées par les Conseils de Faculté :
Le Conseil de Faculté comprend 40 membres, élus pour 4 ans
 
Le Conseil peut décider de la constitution de commissions, dont il fixe le mandat et la durée

La Commission pédagogique propose au Conseil de Faculté la politique de formation de la Faculté

La Commission des stages et gardes propose au Conseil de Faculté l'organisation des stages et gardes à l'hôpital
 
Le Comité Scientifique propose au Conseil de Faculté la politique de recherche de la Faculté, la liste des programmes prioritaires et propose la répartition des crédits de recherche.
 
Pour assurer l'exécution des politiques définies par les Conseils de Faculté et le bon fonctionnement des tâches qui leur incombent, les Doyens disposent de services administratifs